Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pfdn1Q9CWM4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pfdn1Q9CWM4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pfdn1Q9CWM4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Pfdn1Q9CWM4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Pfdn1Q9CWM4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pfdn1Q9CWM4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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