Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Q9CRC3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q9CRC3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms