Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pkp2Q9CQ73 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkp2Q9CQ73 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkp2Q9CQ73 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkp2Q9CQ73 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkp2Q9CQ73 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkp2Q9CQ73 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pkp2Q9CQ73 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pkp2Q9CQ73 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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