Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Bhlhe41Q99PV5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Bhlhe41Q99PV5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms