Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NsmfQ99NF2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms