Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms