Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tlr3Q99MB1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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