Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmp1Q99KU0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms