Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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TrabdQ99JY4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
TrabdQ99JY4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrabdQ99JY4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
TrabdQ99JY4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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