Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pacsin3Q99JB8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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