Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan1Q99J59 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms