Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Med28Q920D3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Med28Q920D3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Med28Q920D3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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