Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp3Q91W36 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp3Q91W36 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp3Q91W36 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Usp3Q91W36 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp3Q91W36 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp3Q91W36 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp3Q91W36 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Usp3Q91W36 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp3Q91W36 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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