Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dnajc28Q8VCE1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Dnajc28Q8VCE1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Dnajc28Q8VCE1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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