Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc12Q8R344 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc12Q8R344 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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