Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Casc3Q8K3W3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Casc3Q8K3W3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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