Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r72Q8K3N7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vmn1r72Q8K3N7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vmn1r72Q8K3N7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vmn1r72Q8K3N7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vmn1r72Q8K3N7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vmn1r72Q8K3N7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vmn1r72Q8K3N7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vmn1r72Q8K3N7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vmn1r72Q8K3N7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vmn1r72Q8K3N7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vmn1r72Q8K3N7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r72Q8K3N7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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