Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
OptnQ8K3K8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms