Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MyripQ8K3I4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms