Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm1Q8K377 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrrtm1Q8K377 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrrtm1Q8K377 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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