Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Nsl1Q8K305 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nsl1Q8K305 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms