Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Fbxo18Q8K2I9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fbxo18Q8K2I9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Fbxo18Q8K2I9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo18Q8K2I9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms