Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim68Q8K243 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim68Q8K243 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim68Q8K243 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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