Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Cldn34c1Q8K193 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c1Q8K193 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms