Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms