Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rbm28Q8CGC6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rbm28Q8CGC6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rbm28Q8CGC6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbm28Q8CGC6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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