Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdkl1Q8CEQ0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms