Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc178Q8CDV0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc178Q8CDV0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc178Q8CDV0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc178Q8CDV0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc178Q8CDV0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc178Q8CDV0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms