Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc27Q8CD92 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ttc27Q8CD92 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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