Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc113Q8C5T8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc113Q8C5T8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms