Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms