Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms