Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Snx17Q8BVL3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx17Q8BVL3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx17Q8BVL3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx17Q8BVL3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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