Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Zfp398Q8BV16 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Zfp398Q8BV16 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Zfp398Q8BV16 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Zfp398Q8BV16 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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