Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops7bQ8BV13 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms