Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop53Q8BK35 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop53Q8BK35 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms