Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf41Q8BH75 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms