Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms