Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim19Q80ZU4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms