Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms