Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms