Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ube3cQ80U95 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ube3cQ80U95 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ube3cQ80U95 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ube3cQ80U95 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ube3cQ80U95 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ube3cQ80U95 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ube3cQ80U95 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3cQ80U95 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms