Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NischQ80TM9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
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NischQ80TM9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
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NischQ80TM9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NischQ80TM9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
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