Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clec18aQ7TSQ1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clec18aQ7TSQ1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms