Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sbno2Q7TNB8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms