Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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