Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rph3alQ768S4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rph3alQ768S4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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