Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Kcnt1Q6ZPR4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Kcnt1Q6ZPR4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Kcnt1Q6ZPR4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Kcnt1Q6ZPR4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Kcnt1Q6ZPR4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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