Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Krt9Q6RHW0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms