Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trak1Q6PD31 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms